Мечеть Зайрек — это второй по величине памятник византийского зодчества, сохранившийся от Константинополя. Церковь состоит из трех связанных друг с другом часовен.
Монастырский комплекс в честь Христа Пантократора (церковь, библиотека, больница) был построен по указанию византийского царя Иоанна Комнена и его супруги Ирины в первой половине XII века. По размерам, красоте и богатству монастырь был один из самых знаменитых в Константинополе. Храм использовался также в качестве усыпальницы для династий Комнин и Палеологов.
После османского завоевания церковь Пантократора стала мечетью. Ее назвали именем ученого Молла Зейрека, который поселился здесь поблизости и организовал религиозную школу.
В течение многих веков здание было практически заброшенным, но в настоящее время останки монастыря постепенно реставрируются.