Национальный исторический музей возник в результате разделения коллекции Музея естественной истории на два музея, второй — Национальный музей антропологии. Музей истории расположен во дворце Чапультепек — бывшей резиденции президента Мексики, самой высокой точке одноименного парка. В 20 залах музея экспонируется более 150000 предметов XVI-XX веков: старинная мебель, оружие, костюмы, украшения, знамена, письменные документы и фотографии, монеты и медали, старинные гравюры, скульптуры и картины. Стены дворца украшают росписи, выполненные рядом известных мексиканских художников. На верхнем этаже музея есть небольшая диарама, воссоздающая комнаты замка во времена правления императора Мексики Максимилиана I (фон Габсбурга), который проживал во дворце со своей женой — бельгийской принцессой Шарлоттой.
В здании музея также располагаются сувенирный магазин, небольшая библиотека, зрительный зал, кафе.