Первый камень в строительстве базилики был заложен в 1594 г. и через 11 лет работы подошли к концу. Это грандиозное и по сегодняшним временам строение возведено на деньги богатого дворянина из камня латерит, которого так много в Гоа. Сейчас базилика является самой посещаемой церковью в Гоа. Охраняется ЮНЕСКО.

Длина базилики 56 м., ширина 17 м., высота 19 м. Изначально она была покрыта штукатуркой, которую удалили в 1951 г. С тех пор соленый бриз с моря разрушает камень. Хотя базилика посвящена Иисусу Христу, интересно, что в центре алтаря стоит 3-х метровая статуя Игнатия де Лойлы - основателя Общества иезуитов. Он стоит в позе экстаза и выглядит как индус. Над монограммой I.H.S. изображена Святая Троица. На небольшом пьедестале, у ног статуи Лойлы расположена статуя маленького Христа.

В 1655 г. справа от главного алтаря сооружена капелла. В ней находится мавзолей из мрамора в смешанном индийском и итальянском стилях. Он появился в 1698 г. после 10 лет работы флорентийского мастера Джованни Батиста Фоджини. А заказал мавзолей герцог Тосканский Косимо III, сделав таким образом, подарок базилике и верующим. У подножия мавзолея 4 бронзовых барельефов со сценками из жизни Франциска Ксаверия. На 4-х метровой вершине мавзолея расположен серебряный ларец, инкрустированный самоцветами. Внутри ларца можно увидеть урну из кристалла. В 1955 г. сюда помещены мощи святого Франциска Ксаверия, хранившиеся до этого в деревянной урне. Имеются три ключа от урны с мощами: первый находится у архиепископа Гоа, второй - у губернатора, третий - у ректора монастыря.